新学年伊始,忍术学园的耐力蛋们陆续返校,但有一年,叶组的西三台却因为作业未完成而没有出现。 原来上学期期末全校的暑假作业都错了。西三太拿到了六年级的作业,他的任务是偷大冢公爵的胯布。 为了找回西三太,导演命令乌丸、新兵卫和其他几个没有完成作业的学生去营救西三太。 另一方面,大冢治虫正在与邻近的黄昏城进行激烈的战斗,銮太郎的小蛋和其他叶集团自愿前往这两个城市监视敌人。 在新的学年里,忍术学院已经全面部署,但它正面临着巨大的危机...这部电影是根据尼子骚兵卫的原创漫画《罗迪忍者銮太郎》改编的,这是同名漫画的第二部剧场版动画,真人版剧场版也于同年上映。